El municipio de Santo Domingo tuvo como embrión urbano los campamentos de trabajadores del Mineral de Santo Domingo, que tuvieron su mayor auge en la década de 1870 a 1880, según tradiciones locales.

Los primeros pobladores de SANTO DOMINGO, fueron mineros indígenas provenientes de la región de Las Segovia, arribaron a SANTO DOMINGO, en el año de 1872.

Hasta el año de 1913, el pequeño caserío o Valle de Santo Domingo era una comarca del municipio de La Libertad.    En ese año por disposición  Legislativa del 17 de Marzo se declaro: "Se eleva a la categoría de Pueblo el valle de Santo Domingo, del departamento de Chontales".   El 4 de Octubre de 1951, por ley legislativa publicada en la Gaceta Oficial del 17 de dicho mes, se elevó el Pueblo de Santo Domingo a la categoría Ciudad.